宜賓PCR技術(shù)在基層疾控中心實(shí)驗(yàn)室的應(yīng)用案例
admin 2020-07-23 05:07:53 閱讀
PCR技術(shù)是一種快速DNA片段擴(kuò)增技術(shù),具有高靈敏性、高特異性、簡(jiǎn)便、快速以及對(duì)標(biāo)本質(zhì)量要求較低的特點(diǎn),已經(jīng)成為一種對(duì)標(biāo)本中的特定DNA片段進(jìn)行研究(research)和檢測(cè)鑒定的重要方法,被廣泛(extensive)用于病毒學(xué)診斷,尤其是病毒性疾病的早期診斷[1]。Real-time PCR是新研制出的一種核酸定量技術(shù),該技術(shù)是在RT-PCR基礎(chǔ)上加入熒光標(biāo)記探針來(lái)實(shí)現(xiàn)其定量功能的,在PCR反應(yīng)系統(tǒng)中引入了熒光標(biāo)記探針具有高靈敏性、高特異性和高精確性的特點(diǎn)。PCR 技術(shù)在基層疾控中心的開展,提高了基層實(shí)驗(yàn)(experiment)室的技術(shù)能力,為流行病疫情的流行水平和變化趨勢(shì)(variation tendency)提供科學(xué)有效的數(shù)據(jù),為我市的疾病防控工作能力提供了技術(shù)支撐,也為分子生物學(xué)在基層實(shí)驗(yàn)室開展研究奠定基礎(chǔ),在現(xiàn)代疾病預(yù)防控制事業(yè)中起到了巨大的作用。
1 方法
1.1 吳忠市疾控中心申請(qǐng)建立PCR實(shí)驗(yàn)室。
吳忠市PCR實(shí)驗(yàn)室的建立有其歷史必要性。的5月,還沒有特效治療的藥物,尚無(wú)有效的預(yù)防疫苗,相關(guān)的疫苗研發(fā)正在進(jìn)行之中[2]。甲型H1N1流感疫情的蔓延和流行趨勢(shì),引起全球人民的高度恐慌。我國(guó)密切關(guān)注甲型H1N1流感的發(fā)生和傳播,各級(jí)疾控中心加強(qiáng)監(jiān)測(cè)和檢測(cè),及時(shí)應(yīng)對(duì)疫情的發(fā)生。面對(duì)可能(maybe)大規(guī)模爆發(fā)的流感疫情,我們的實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)工作已經(jīng)無(wú)法解決對(duì)疫情病毒的確診工作,無(wú)法滿足這種空前危機(jī)的局勢(shì),擴(kuò)大流感檢測(cè)實(shí)驗(yàn)室,應(yīng)對(duì)疫情危機(jī)已經(jīng)是迫在眉睫的問題。實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)是確診流感病例的重要依據(jù),為進(jìn)一步加強(qiáng)疫情監(jiān)測(cè),嚴(yán)防疫情擴(kuò)散,需逐步將現(xiàn)有流感監(jiān)測(cè)網(wǎng)絡(luò)實(shí)驗(yàn)室擴(kuò)大到所有地市級(jí)疾病預(yù)防控制(control)中心,因此建立基層PCR實(shí)驗(yàn)室是這種歷史時(shí)期的必然趨勢(shì)。
PCR實(shí)驗(yàn)室是分子生物實(shí)驗(yàn)室,因其技術(shù)參數(shù)條件高,造價(jià)昂貴,開展工作耗資巨大,因此很難在基層實(shí)驗(yàn)室建立。,在特定的歷史時(shí)期,寧夏吳忠市疾控中心積極向上級(jí)部門和地方政府匯報(bào)建立PCR實(shí)驗(yàn)室的必要性,并申請(qǐng)項(xiàng)目資金,申請(qǐng)審批在吳忠市疾控中心建立PCR實(shí)驗(yàn)室。
1.2 RT-PCR技術(shù)和Real-time PCR技術(shù)在基層疾控中心實(shí)驗(yàn)(experiment)室的運(yùn)用。大學(xué)實(shí)驗(yàn)室國(guó)家科技創(chuàng)新體系的重要組成部分,高等學(xué)校創(chuàng)新性人才的培養(yǎng)基地,在高校學(xué)科建設(shè)、科技創(chuàng)新、人才培養(yǎng)和培育國(guó)家級(jí)科研基地中發(fā)揮著越來(lái)越重要的作用。
寧夏吳忠市PCR實(shí)驗(yàn)(experiment)室按照標(biāo)準(zhǔn)配置了普通PCR擴(kuò)增儀、定量Real-time實(shí)時(shí)熒光PCR儀、電泳儀、凝膠(gelate)成像儀、倒置顯微鏡、A2型生物安全柜、B2型生物安全柜、超凈工作臺(tái)、低溫冷凍離心機(jī)、培養(yǎng)箱、高壓鍋、-70攝氏度低溫冷凍冰箱、純水儀等儀器設(shè)備30余件。動(dòng)物實(shí)驗(yàn)室通過對(duì)動(dòng)物本身生命現(xiàn)象的研究,進(jìn)而推用到人類,探索人類的生命奧秘,控制人類的疾病和衰老,延長(zhǎng)人類的壽命。隨著醫(yī)學(xué)生物科學(xué)的突飛猛進(jìn)發(fā)展,認(rèn)識(shí)到公害問題不僅已成為糧食、人口、老年人等的重大社會(huì)問題,而且還涉及到地球上生活著的動(dòng)物生存問題。
在PCR實(shí)驗(yàn)(experiment)室建設(shè)同時(shí),吳忠市疾控中心先后派出2名專業(yè)技術(shù)人員到寧夏自治區(qū)疾控中心病毒實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行了專項(xiàng)培訓(xùn)(作用:知識(shí)傳遞、技能傳遞、標(biāo)準(zhǔn)傳遞),通過考核,獲得了上崗證書。
11月22日,經(jīng)過寧夏回族自治區(qū)疾控中心專家的現(xiàn)場(chǎng)流感樣盲樣的考核驗(yàn)收,達(dá)標(biāo)后以RT-PCR技術(shù)開展流感核酸檢測(cè)工作開始正式投入使用,標(biāo)志著PCR技術(shù)首次在基層實(shí)驗(yàn)室的開展。
2 結(jié)果
2.1 在國(guó)家和地方政府的大力支持下,在單位領(lǐng)導(dǎo)的努力和各位專家的指導(dǎo)下,吳忠市PCR實(shí)驗(yàn)室于同年11月份建成。
寧夏吳忠市PCR實(shí)驗(yàn)室嚴(yán)格按照生物安全Ⅱ級(jí)的要求在市疾控中心進(jìn)行設(shè)計(jì)和建設(shè)。 PCR技術(shù)基本原理就是將感樣本的特異基因組核酸基因片段通過聚集、提取、擴(kuò)增,分析其擴(kuò)增產(chǎn)物來(lái)確定流感病毒的類型。完成一組PCR實(shí)驗(yàn),通常應(yīng)經(jīng)過試劑配制、樣品處理、核酸擴(kuò)增及產(chǎn)物分析四個(gè)實(shí)驗(yàn)過程[3]。
寧夏吳忠市疾控中心的PCR實(shí)驗(yàn)室在環(huán)境結(jié)構(gòu)上是組合形式的PCR實(shí)驗(yàn)室,是指完成PCR四個(gè)實(shí)驗(yàn)過程的實(shí)驗(yàn)和用房是相鄰布置的,組成獨(dú)立實(shí)驗(yàn)區(qū)域的形式。實(shí)驗(yàn)室設(shè)有PCR內(nèi)部專用走廊。實(shí)驗(yàn)室間有試劑配制室、樣品處理室、核酸擴(kuò)增室及核酸擴(kuò)增產(chǎn)物分析(Analyse)室組成。各室在入口處設(shè)置有緩沖間,以減少室內(nèi)外空氣交換。我中心的PCR實(shí)驗(yàn)室是通過獨(dú)立的送排風(fēng)系統(tǒng),控制(control)氣流方向和壓差,氣流由清潔區(qū)流向污染區(qū) 。
2.2 目前,吳忠市PCR實(shí)驗(yàn)室運(yùn)用RT-PCR技術(shù)和Real-time PCR技術(shù)承擔(dān)來(lái)自哨點(diǎn)醫(yī)院(吳忠市人民醫(yī)院)的發(fā)熱病人的流感樣樣本的常規(guī)檢測(cè),同時(shí)還擔(dān)負(fù)著整個(gè)吳忠市轄區(qū)暴發(fā)集體發(fā)熱疫情的現(xiàn)場(chǎng)快速檢測(cè)及實(shí)驗(yàn)室確診檢測(cè)工作,確診流感病毒類型及分型。運(yùn)用Real-time PCR技術(shù)和雙重Real-time PCR技術(shù)對(duì)本手足口病樣核酸鑒定和分型。對(duì)流感樣和手足口病樣核酸檢測(cè),吳忠市PCR實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)的陽(yáng)性樣品,全部都及時(shí)送到寧夏回族自治區(qū)疾控中心病毒科實(shí)驗(yàn)室復(fù)核(審查核對(duì)),結(jié)果一致,沒有出現(xiàn)結(jié)果異?;蛘呤遣环锨闆r。國(guó)家流感中心在10月和10月,兩次組織對(duì)國(guó)家流感網(wǎng)絡(luò)絡(luò)實(shí)驗(yàn)室分別進(jìn)行為數(shù)10份的流感盲樣標(biāo)本分型考核,盲樣考核樣品由國(guó)家流感中心統(tǒng)一提供。吳忠市疾控中心流感網(wǎng)絡(luò)實(shí)驗(yàn)室的考核盲樣結(jié)果符合率均為100%,順利通過,這是對(duì)工作人員盡快掌握RT-PCR技術(shù)和Real-time PCR技術(shù)的肯定。吳忠市PCR實(shí)驗(yàn)室自建成開展工作以來(lái),無(wú)安全事故發(fā)生,沒有檢測(cè)結(jié)果錯(cuò)誤情況,一切運(yùn)轉(zhuǎn)正常。
3 結(jié)論:
3.1 吳忠市PCR實(shí)驗(yàn)(experiment)室運(yùn)用RT-PCR技術(shù)和Real-time PCR技術(shù)檢測(cè)包括甲型H1N1流感在內(nèi)的各種流感病毒核酸,及時(shí)確診流感病毒的類型及其亞型,為流感疫情的流行水平和變化趨勢(shì)(variation tendency)提供科學(xué)有效的數(shù)據(jù),為提高我市的疾病防控工作能力提供了技術(shù)支撐?;瘜W(xué)實(shí)驗(yàn)室人們利用它們來(lái)探索學(xué)習(xí)物質(zhì)及其變化的奧秘。進(jìn)入化學(xué)實(shí)驗(yàn)室之前一定要仔細(xì)閱讀實(shí)驗(yàn)室規(guī)則,嚴(yán)格按照規(guī)則操作。因?yàn)楹芏嗟幕瘜W(xué)藥品對(duì)人體的危害性非常大,對(duì)環(huán)境也有較大污染。
3.2 在吳忠市PCR實(shí)驗(yàn)(experiment)室運(yùn)用熒光定量PCR技術(shù)和雙重?zé)晒舛縋CR技術(shù)檢測(cè)手足口病核酸分型,暴發(fā)疫情快速確診腸道病毒類型,掌握EV71和CoxA16感染流行(Prevalent)特征,為疫情的流行水平和變化趨勢(shì)提供科學(xué)有效的數(shù)據(jù),同時(shí)為臨床診斷以及制定預(yù)防措施提供依據(jù)。
3.3 吳忠市PCR實(shí)驗(yàn)室,作為一個(gè)分子診斷實(shí)驗(yàn)室,能夠?yàn)閷?lái)開展PCR技術(shù)支持的任何其它病毒核酸檢測(cè)提供實(shí)驗(yàn)環(huán)境,在今后的發(fā)展中將會(huì)發(fā)揮其最大效應(yīng),也許在不久的將來(lái),丙肝病毒、艾滋病毒、乙腦病毒、輪狀病毒、流感病毒、麻疹(measles)病毒、腺病毒、EB病毒、風(fēng)疹病毒等需要PCR技術(shù)支持病毒核酸檢測(cè)都能夠在吳忠市疾控中心這樣的基層PCR實(shí)驗(yàn)室完成。PCR技術(shù)在吳忠市疾控中心實(shí)驗(yàn)室的運(yùn)用,提高了實(shí)驗(yàn)室的技術(shù)能力,也為分子生物學(xué)在基層實(shí)驗(yàn)室開展研究奠定基礎(chǔ)。。
寧夏吳忠市PCR實(shí)驗(yàn)室的建成啟用,極大地提高了我市流感傳染病和手足口病診斷的及時(shí)性和準(zhǔn)確性,對(duì)有效預(yù)防控制流感病毒和手足口病傳染病發(fā)揮重要的指導(dǎo)性作用。RT-PCR技術(shù)和Real-time PCR技術(shù)在基層疾控中心實(shí)驗(yàn)室的運(yùn)用,吳忠市疾控中心實(shí)驗(yàn)室首次具備核酸檢測(cè)能力,提高了基層實(shí)驗(yàn)室的技術(shù)能力,為流行(Prevalent)病疫情的流行水平和變化趨勢(shì)提供科學(xué)有效的數(shù)據(jù),為我市的疾病防控工作能力提供了技術(shù)支撐,也為分子生物學(xué)在基層實(shí)驗(yàn)室開展研究奠定基礎(chǔ)。建立基層PCR實(shí)驗(yàn)室不盡是基層實(shí)驗(yàn)室能力建設(shè)的一個(gè)巨大飛躍,更是在現(xiàn)代疾病預(yù)防控制事業(yè)中起到了巨大的作用。